函授档案丢失是可以重新补办的，第一步开档案遗失证明，第二步开档案补办证明，第三步准备补办档案所需的材料，第四步，将档案放在具有存放档案资格的机关进行托管。开好档案遗失证明后，去到工作单位当地的人事局或部分国企单位即可开补办档案的证明。通常补办档案需要学生登记表，学籍卡，成绩单和毕业生登记表等材料。拿着补办档案的证明去到学校的学籍管理处可以查询到补办档案所需的材料。将所有资料找齐，学校档案处就可补办新的档案，完成后可以凭借调档函将档案调到新的存储单位，档案就算补办完成了。
大专生若对自己档案不确定，可以向原单位或原单位主管部门查询，也可直接打电话到生源地人才办咨询，也可向毕业生就业主管部门或原单位所在地政府人社部门人才服务机构查询，如果以上三种方法不能查询到档案，则需要回到毕业学校查询，但是如果毕业很长时间，原学校就不一定会有存档，所以学生的档案还是应该自己有备份。
函授档案的保管方式有三种，第一种进入公司之后，如果公司有人事档案管理权限，就可以将档案直接转入到公司人事管理部门，保管公司人事会协助将档案存放在公司，这样计算工龄最为方便。第二种，如果公司单位没有档案管理权或档案存放权，这种时候要联系工作单位所在的乡镇的人才交流中心解决档案保管问题，只要妥善保管就行。若工作单位人才交流中心不接受档案，则可以联系户口所在地的人才市场。各地的政策不同，因此档案的存放可能会有所差异，可以将函授学籍档案存放到原档案处，合并后存放。
如果函授档案一直在自己手上，且被拆开，但档案材料没有丢失，可以联系学校帮忙密封，将高中和大专档案存放在一起。若档案一直在自己手上被拆开，且档案材料丢失，则需要回到原毕业学校补办材料，将补办的材料盖章并将档案密封，然后与高中档案和大专档案存放在一起，函授本科档案在各种单位，企业以及对员工的职称，工资研究生，公务员等考试中都起到重大作用，国家对于自考本科是承认的，也是支持的。因此，大家绝不可忽视自己的函授档案，要按照国家规定进行存放。函授本科毕业生收到档案同样不可拆封，一定要送到有档案管理权限的机关托管。
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